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Nouvelles technologies leur exploitation Nouvelles technologies et leur exploitation Code BédéO : BNF202 Code RNCP : |
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| OBJECTIFS PÉDAGOGIQUES | COMPÉTENCES VISÉES | CONDITIONS D'ACCÈS / PRÉREQUIS |
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BNF104. Cours s'adressant à des auditeurs ayant déjà acquis un niveau L3 en biologie/bio-informatique. Programmation: notions de R et de Python. |
| MODALITÉS DE DÉPLOIEMENT | Période | Crédits ECTS |
| [{"id":"CC","libelle":"Contr\u00f4le continu","description":"Contr\u00f4le de connaissances et de savoirs qui se d\u00e9roule tout le long du temps de l'enseignement"},{"id":"PR","libelle":"Projet(s)","description":"Projet(s) \u00e0 r\u00e9aliser amenant la livraison d'un livrable"},{"id":"EX","libelle":"Examen final","description":"Examen final portant sur l'ensemble des connaissances et des savoirs de l'enseignement"}] | 2024-09-16 - 2025-01-18 | 6 |
| Année universitaire | Certificateur | Dates d'accréditation |
| Premier semestre | Information Indisponible | 2025-01-17 17:28:57 |
Condition d'accès / publics visés:
BNF104. Cours s'adressant à des auditeurs ayant déjà acquis un niveau L3 en biologie/bio-informatique.
Programmation: notions de R et de Python.
Objectifs pédagogiques:
- Utiliser les outils de la recherche reproductible
- Comprendre et analyser les enjeux de la médecine personnalisée dans une ère de big data
- Connaître les formes que prend la diversité génétique humaine et comprendre son lien avec les pathologies humaines
- Se familiariser avec la représentation des données génétiques
- Savoir mettre en œuvre des simulations de phénotype (modèle infinitésimal)
- Savoir mettre en œuvre une étude d'association génétique et analyser les résultats de façon critique
- Se familiariser avec les techniques post-génomiques et de génomique statistiques
Compétences visées :
- Utilisation de Plink pour les études d'association génétique
- Concepts fondamentaux de génétique des populations
- Modèles élémentaires de relation génotype-phénotype pour des phénotypes polygéniques
Contenu de la formation:
- Outils programmatiques (shell, Python) et applications (git, R Markdown, JupyterHub) permettant le déploiement et la documentation de pipelines bio-informatiques modernes.
- Recherche d'associations génétiques et méthodes statistiques pour la biologie moderne à haut débit (régression linéaire, valeurs P, classification, winner's curse).
- Méthodes de puces de génotypage pour la médecine ou la généalogie génétique (par exemple, scores de risque polygéniques et du séquençage pour le diagnostique par biopsie liquide) avec les outils dédiés, R (suite Bioconductor)
- Études bibliographiques sur les méthodes bio-informatiques récentes sur le séquençage massif de l'ADN (NGS) et ses applications en médecine personnalisée.
Modalités de validation et d’évaluation:
Contrôle continu: Contrôle de connaissances et de savoirs qui se déroule tout le long du temps de l'enseignement
Projet(s): Projet(s) à réaliser amenant la livraison d'un livrable
Examen final: Examen final portant sur l'ensemble des connaissances et des savoirs de l'enseignement
Accompagnement et suivi à Compléter:
Cette UE est constitutive des diplômes suivants:
[{"code":"CS8800A","code_suivi":976,"date_debut_validite":"2019-09-01","date_fin_validite":"9999-08-31","affichable":true},{"code":"CS8800A","code_suivi":976,"date_debut_validite":"2024-02-05","date_fin_validite":"9999-08-31","affichable":true}] ECTS: 6
| Volume Horaire | Financement individuel hors tiers financeur et CPF | Tarif de référence (Employeur) |
|---|---|---|
| 45 heures | Information Indisponible | Information Indisponible |
Indexation officielle FORMACODES:
[{"code":"C0A5A3","code_officiel":"12081","descripteur_majuscule":"BIOTECHNOLOGIE","descripteur_riche":"biotechnologie","parent":{"code":"C0A5","code_officiel":"12054","descripteur_majuscule":"SCIENCES NATURELLES","descripteur_riche":"sciences naturelles","parent":{"code":"C0","code_officiel":"103","descripteur_majuscule":"SCIENCES","descripteur_riche":"sciences"}}},{"code":"C0A5A0A1","code_officiel":"12008","descripteur_majuscule":"BIO-INFORMATIQUE","descripteur_riche":"bio-informatique","parent":{"code":"C0A5A0","code_officiel":"12046","descripteur_majuscule":"BIOLOGIE","descripteur_riche":"biologie","parent":{"code":"C0A5","code_officiel":"12054","descripteur_majuscule":"SCIENCES NATURELLES","descripteur_riche":"sciences naturelles","parent":{"code":"C0","code_officiel":"103","descripteur_majuscule":"SCIENCES","descripteur_riche":"sciences"}}}},{"code":"C0A5A0A7","code_officiel":"12049","descripteur_majuscule":"GENETIQUE","descripteur_riche":"génétique","parent":{"code":"C0A5A0","code_officiel":"12046","descripteur_majuscule":"BIOLOGIE","descripteur_riche":"biologie","parent":{"code":"C0A5","code_officiel":"12054","descripteur_majuscule":"SCIENCES NATURELLES","descripteur_riche":"sciences naturelles","parent":{"code":"C0","code_officiel":"103","descripteur_majuscule":"SCIENCES","descripteur_riche":"sciences"}}}}] Dernière mise à jour: 17/01/2025 17:28:57
INFOS PRATIQUES
45 heures
Modalité"Formation à distance planifiée"
PériodePremier semestre
Date de début des cours2024-09-16
Date de fin des cours2025-01-18
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Actuellement, l’offre régionale est uniquement disponible, l’offre nationale est en cours de préparation.
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ACTIONS DE FORMATION
ACTIONS DE FORMATION PAR APPRENTISSAGE
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